液相色譜技術在基因雜質分析中的重要作用
高效液相色譜技術(HPLC) HPLC 作為最傳統的方法在雜質分離中仍然使用得最多。
通過各種色譜柱技術以及聯用技術能夠對絕大多數化合物實現分離、分析。
為了解決與紫外檢測器聯用靈敏度低的問題，新型二維 高 效 液 相 色 譜 (2D-HPLC)利用了液相色譜技術分離和富集的特點提高了對低濃度雜質的檢測能力。
目前，HPLC 無論采用正相洗脫還是反相洗脫都需消耗大量的有機溶劑，這對環境帶來較大的污染，因此提出以水或其他環境友好的試劑為主要洗脫溶劑的新型液相色譜技術正得到廣泛的研究。
超高效液相色譜技術(UHPLC) 為了應對藥物研發的需要，UHPLC 作為一種快速分離的色譜技術已經出現在各種藥物的開發上。
根據UHPLC 的使用方法，討論了如何針對不同樣品建立穩定的 UHPLC 方法。
手性分離方面，UHPLC目前并沒有大量小于2 μm 粒徑的商品化手性色譜柱，但是利用傳統的手性流動相添加法也可實現對手性雜質進行分離。
在實驗室建設方面，分析實驗室目前仍以 HPLC 為主要研究儀器，但為了獲得類似于UHPLC 分離效能，許多科研工作者通過優化 HPLC系統同時使用核殼型色譜柱實現了快速分離。
以液態CO2 為主要流動相的SFC 技術，由于其與紫外聯用檢測靈敏度低，其發展一直非常緩慢，但質譜檢測器(MS)的普及以及環境友好型社會的需要，使 SFC 能用于分離手性雜質。
雖然 SFC 與質譜聯用技術用于雜質分析已有相關報道 ，但商品化的 SFC-MS聯用儀器并未大量出現。
為實現對雜質的定量及定性分析，需要獲取高純度單一成分的雜質，然而雜質在藥物中含量較低，利用分析型液相色譜技術制備雜質需要消耗大量時間，利用制備型液相色譜技術等方法可提高高純度雜質的獲取速度，加快雜質研究工作。經純化的雜質可獲得更高質量的圖譜，但藥物中雜質含量低的問題一直制約著雜質單體的獲取速度。
利用液質聯用方法可獲得雜質的來源與簡單結構，再利用強制降解 、結晶母液或直接合成等方式可制備出雜質單體制備技術上。
為了克服常規一維制備型液相色譜技術以及制備型SFC 色譜技術的方法建立困難、制備時間較長等缺點而提出制備型的二維液相色譜技術(Prep 2D-LC)以及二維 SFC 色譜技術已得到越來越多的應用。一種新型的 Prep 2D-LC，該儀器首先通過一維液相色譜對樣品進行初步分離，并用質譜相對分子質量監控和中心切割的方式將目標物保存在樣品環(Sample loop)中，再利用在柱洗脫(at column dilution)的方法將樣品環中的樣品進樣至第二維液相色譜中，第二維液相色譜通過使用與第一維相同或者不同的流動相對樣品進行進一步分離同時使用質譜監控方法即可得到更高純度的目標物。這種新方法不僅替代了一維制備型液相色譜，同時解決了傳統制備2D-LC 系統高壓以及峰展寬的問題。
